Tutkija, postdoc, työskentelee Business Finlandin rahoittamassa Q-GEN-hankkeessa (Quantum Computing Applications for Future Genomes and Biomaterials).

Sekvensointimenetelmien nopea kehitys tuottaa valtavia ja monimutkaisia omiikka-aineistoja, joiden analysointi haastaa perinteiset laskentamenetelmät. Kvanttilaskenta tarjoaa mahdollisuuden ratkaista näiden monitahoisen aineistojen analysointiin liittyviä pullonkauloja, mutta toistaiseksi kvanttitietokoneita on hyödynnetty heikosti bioinformatiikan alalla.

Tutkija sijoittuu Luonnonvarakeskuksen (Luke) Kasvigenetiikka- ja genomiikka tutkimusryhmään. Tehtävänä on tunnistaa bioinformatiikan ongelmia, joihin voidaan soveltaa kvantti- tai hybridilaskennallisia menetelmiä, kehittää uusia algoritmeja yhteistyössä Aaltoyliopiston kvanttifysiikan tutkijoiden kanssa sekä soveltaa kehitettyjä menetelmiä simuloiduissa ja todellisissa kvanttilaskentaympäristöissä.

Tutkimus keskittyy ensisijaisesti omiikka-aineistojen analysointiin kasveilla. Mahdollisia sovelluskohteita ovat muun muassa geeniverkostojen estimointi ja multiomiikka-aineistojen mallintaminen.

Tutkijan ohjaajina toimivat Tuomas Hämälä ja Daniel Fischer (Luke), ja hän tekee tiivistä yhteistyötä Ilkka Tittosen tutkimusryhmän kanssa (Aalto Yliopisto). Tehtävä sijoittuu Luken toimipisteeseen joko Jokioisille tai Helsinkiin. Tehtävään liittyy mahdollisuus tutkimusvierailuihin kansainvälisten yhteistyökumppanien luo.

• äskettäin suoritettua tohtorin tutkintoa (tyypillisesti enintään 5 v sitten) soveltuvalta alalta, kuten bioinformatiikka, genetiikka, koneoppiminen tai datatiede
• kokemusta laajojen omiikka-aineistojen analysoinnista
• vahvaa ohjelmointiosaamista, mieluiten Pythonilla
• kokemusta Unix-pohjaisista suurteholaskentaympäristöistä (HPC)
• hyviä viestintätaitoja
• kykyä työskennellä itsenäisesti sekä osana monitieteellistä tutkimusryhmää
• erinomaista suullista ja kirjallista englannin kielen taitoa

Kokemus kvanttilaskenta-alustoista, kuten IBM Qiskitistä, sekä koneoppimisesta katsotaan eduksi. Huomioimme arvioinnissa myös hakijan tieteellisten julkaisujen määrän ja laadun, erityisesti bioinformatiikkaan, kasvigenomiikkaan, koneoppimiseen ja kvanttilaskentaan liittyvien julkaisujen osalta. Lisäksi suomen kielen taito katsotaan eduksi.

Virkaan tai tehtävään valittavasta henkilöstä voidaan tehdä hakijan suostumuksella perusmuotoinen henkilöturvallisuusselvitys (turvallisuusselvityslaki 726/2014). Menettelystä ja selvityksen kohteen oikeuksista löytyy tarkempia tietoja osoitteessa www.supo.fi.

Sirja Viitala
Tutkimuspäällikkö, tavoitettavissa 15.10 klo 9-11 ja 15-17 sekä 16.10 klo 9-11 ja 15-17
+358 29 532 6636
sirja.viitala@luke.fi

Daniel Fischer
Erikoistutkija
+358 29 532 6670
daniel.fischer@luke.fi

Tuomas Hämälä
Erikoistutkija, tavoitettavissa 9.10. klo 12-16, 16.10. klo 12-16 ja 23.10. klo 12-16
+358 29 532 2239
tuomas.hamala@luke.fi

Luonnonvarakeskuksen kirjaamo

Latokartanonkaari 9
00790 Helsinki

Luonnonvarakeskus (Luke) on tutkimus- ja asiantuntijaorganisaatio, joka rakentaa hyvinvointia ja kestävää tulevaisuutta uusiutuvista luonnonvaroista. Tuotamme tietoon perustuvia ratkaisumalleja ja palveluita asiakkaillemme sekä lisäarvoa uusiutuviin luonnonvaroihin perustuvalle kestävälle ja kilpailukykyiselle elinkeinotoiminnalle. Tuemme lisäksi luonnonvaroihin ja luonnonvaratalouteen liittyvää yhteiskunnallista päätöksentekoa.

Luken toimialasta, tehtävistä ja organisaatiosta säädetään Luonnonvarakeskuksesta annetussa laissa (561/2014). Toimimme maa- ja metsätalousministeriön toimialalla.

Meitä lukelaisia yhdistävät ystävällisyys, uteliaisuus ja halu vaikuttaa maailmaan myönteisesti. Arvostamme monimuotoista, eri taustoista ja kulttuureista rakentuvaa työyhteisöämme ja edistämme yhdenvertaisuutta. Rakennamme yhdessä hyväntuulista ja kunnioittavaa kulttuuria, jossa jokaisen työtä arvostetaan. Vastuullisuus kulkee läpi kaiken toimintamme.

• Lisätietoja: Jokaisesta valittavasta henkilöstä tehdään pakotetarkastus, joka perustuu kansainvälisten ja kansallisten pakotevelvoitteiden noudattamiseen. Valittavasta henkilöstä voidaan lisäksi tehdä taustatarkastus, jolla voidaan varmentaa henkilön antamien tietojen oikeellisuutta, jos henkilöllä ei ole Suomen kansalaisuutta.
• Tehtävän taso: Asiantuntijataso
• Etätyö: Kokoaikainen tai osittainen etätyö
• Etätyön kuvaus: Lukessa tehdään työtä monipaikkaisesti eli työtä tehdään siellä, missä se on tarkoituksenmukaisinta. Monipaikkainen työ on mahdollista ainoastaan Suomessa ja käytännöistä sovitaan esihenkilön kanssa. Kohtaamme toisemme säännöllisesti myös kasvokkain.
• Määräaikaisuuden peruste: Työn luonne
• Määräaikaisuuden lisätietoja: Q-Gen (Quantum Computing Applications for Future Genomes and Biomaterials) hanke
• Työaikamuoto: Virastotyöaika
• Koeaika: Koeaika on puolet palvelussuhteen kestosta, kuitenkin enintään kuusi (6) kuukautta.
• Palkkatiedot: Tehtävä sijoittuu Luonnonvarakeskuksen palkkausjärjestelmän vaativuustasolle 8, jossa tehtäväkohtainen palkanosa on 3704,31 euroa kuukaudessa. Tehtäväkohtaisen palkanosan lisäksi maksetaan henkilökohtaiseen suoritukseen perustuva palkanosa, joka voi olla enintään 50 % tehtäväkohtaisesta palkanosasta. Uuden työntekijän henkilökohtainen palkanosa on osaamisesta ja kokemuksesta riippuen tyypillisesti 15–20 %. Hakija voi esittää myös oman palkkatoivomuksensa.