Forskaren, postdoc, arbetar inom det Business Finland-finansierade Q-GEN-projektet (Quantum Computing Applications for Future Genomes and Biomaterials).

Den snabba utvecklingen av sekvenseringsmetoder genererar enorma och komplexa omikdata, vars analys utmanar traditionella beräkningsmetoder. Kvantberäkning erbjuder möjligheter att lösa flaskhalsar som är förknippade med analysen av dessa komplexa datamängder, men hittills har kvantdatorer utnyttjats i begränsad utsträckning inom bioinformatiken.

Forskaren blir en del av forskningsgruppen för växtgenetik och genomik vid Naturresursinstitutet (Luke). Till arbetsuppgifterna hör att identifiera bioinformatiska problem där kvantberäkningsmetoder eller hybrida beräkningsmetoder kan tillämpas, utveckla nya algoritmer i samarbete med kvantfysikforskare vid Aalto-universitetet samt tillämpa de utvecklade metoderna i simulerade och verkliga kvantberäkningsmiljöer.

Forskningen fokuserar i första hand på analys av omikdata från växter. Möjliga tillämpningsområden är bland annat estimering av gennätverk och modellering av multiomikdata.

Forskaren handleds av Tuomas Hämälä och Daniel Fischer vid Luke och samarbetar nära med Ilkka Tittonens forskningsgrupp vid Aalto-universitetet. Tjänsten är placerad vid Lukes verksamhetsställe antingen i Jockis eller Helsingfors. I uppgiften ingår möjlighet till forskningsbesök hos internationella samarbetspartner.

• en nyligen avlagd doktorsexamen, vanligtvis avlagd för högst fem år sedan, inom ett lämpligt område såsom bioinformatik, genetik, maskininlärning eller datavetenskap
• erfarenhet av analys av omfattande omikdata
• stark programmeringskompetens, helst i Python
• erfarenhet av Unix-baserade miljöer för högpresterande databehandling (HPC)
• god kommunikationsförmåga
• förmåga att arbeta självständigt och som en del av en tvärvetenskaplig forskningsgrupp
• utmärkta muntliga och skriftliga kunskaper i engelska

Erfarenhet av kvantberäkningsplattformar, såsom IBM Qiskit, samt av maskininlärning ses som en fördel. I bedömningen beaktar vi även antalet vetenskapliga publikationer och deras kvalitet, särskilt publikationer inom bioinformatik, växtgenomik, maskininlärning och kvantberäkning. Dessutom ses kunskaper i finska som en fördel.

Av den som väljs till tjänsten eller befattningen kan med sökandens samtycke göras en normal säkerhetsutredning av person (säkerhetsutredningslagen 726/2014). Närmare information om förfarandet och rättigheterna för den som utredningen gäller finns på adressen www.supo.fi.

Sirja Viitala
Forskningschef, anträffbar 15.10 kl 9-11 och 15-17 och 16.10 kl 9-11 och 15-17
+358 29 532 6636
sirja.viitala@luke.fi

Daniel Fischer
Special forskare
+358 29 532 6670
daniel.fischer@luke.fi

Tuomas Hämälä
Special forskare, anträffbar 9.10. kl 12-16, 16.10. kl 12-16 och 23.10. kl 12-16
+358 29 532 2239
tuomas.hamala@luke.fi

Registratorskontoret vid Naturresursinstitutet

Latokartanonkaari 9
00790 Helsingfors

Naturresursinstitutet (Luke) är en forsknings- och expertorganisation som byggas välbefinnande och hållbar framtid från förnybara naturresurser. Vi levererar kunskapsbaserade lösningar och tjänster till våra kunder, vilket ger mervärde till hållbara och konkurrenskraftiga verksamheter baserade på förnybara naturresurser. Vi stöder också samhällets beslutsfattande när det gäller naturresurser och resursekonomi.

Lukes verksamhetsområde, uppgifter, organisation och ledning regleras i lagen om Naturresursinstitutet (561/2014). Institutet verkar inom ramen för jord- och skogsbruksministeriets verksamhetsområde.

Saker som förenar Luke-människor är nyfikenhet och ett öppet sinne samt en stark vilja att vara med och påverka världen i en positiv riktning. Vi värdesätter att våra medarbetare kommer från olika bakgrunder och kulturer och vi främjar jämlikhet. Utgående från detta bildar vi en positiv och respektfull arbetsmiljö, där varje medarbetares insats är viktig. Samhällsansvar genomsyrar hela vår verksamhet.

• Mer information: Varje utvald person kommer att genomgå en sanktionskontroll baserad på efterlevnad av internationella och nationella sanktionsförpliktelser. Den utvalda personen kan också genomgå en bakgrundskontroll för att verifiera riktigheten av den information som lämnats om personen inte har finskt medborgarskap.
• Uppgiftsnivå: Expertuppgifter
• Distansarbete: Distansarbete på heltid eller deltid
• Beskrivning av distansarbete: På Naturresursinstitutet arbetar vi multilokalt, det vill säga på den plats där det är mest ändamålsenligt. Multilokalt arbete är möjligt endast i Finland och de praktiska arrangemangen för det avtalas med chefen. Vi träffar också varandra fysiskt på regelbundna möten.
• Grund för visstidsanställning: Arbetets art
• Ytterligare information om visstidsanställning: Q-Gen (Quantum Computing Applications for Future Genomes and Biomaterials) projekt
• Arbetstid: Arbetstid vid ämbetsverk
• Prövotid: Provperioden är hälften av anställningskontraktets längd, dock högst sex (6) månader.
• Löneuppgifter: Tjänsten placerar sig på kravnivå 8 i Naturresursinstitutets lönesystem, där den uppgiftsbaserade lönedelen är 3704,31 euro i månaden. Dessutom betalas en på den individuella arbetsprestationen baserad lönedel som är högst 50 procent av den uppgiftsbaserade lönedelen. Beroende på kompetens och erfarenhet uppgår den nyanställda medarbetarens lönedel vanligen till 15 - 20 %. Du kan även lämna löneanspråk på ansökan.